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新物鉴定一般都有九个流程:
1、16S相似度。
2、形态学观察。
比如这个菌的形状、大小、鞭毛情况等等,还包括最适生长条件的确定。
3、磷脂脂肪酸鉴定,这个具有属特异性。
4、呼吸醌,也就是看一下占优势的呼吸醌是哪种,这个有种特异性。
5、分子杂交,也就是测定基因组序列,草图就行,然后跟近源物种去比较。
相似度超过70%是一个种,低于70%是不同物种。
6、碳源利用情况,看一下能利用哪些碳源,一共有95种碳源的测试。
7、API试剂盒鉴定,生理生化鉴定的一方面。
8、GC含量。
9、革兰氏染色。
大概经过这些方面的检查,就可以确定是不是新种了。(注:不知道这样写的比较详细大家愿不愿意看?这种详细流程应该没有其他书写过,找人问其实很麻烦的,要是还被嫌水下次我就不写了)
其中第五个流程,也就是分子杂交这次可以直接忽略——毕竟第一部测出来的46.9%实在是差距太明显了。
考虑到时间问题,徐云将几个步骤逐一分工,由几位工具人……咳咳,课题组成员同步进行。
五个小时后。
一道最终报告出炉了。
“节丛孢属的一类全新微生物,1000倍油镜下可观察到形态,体外具备大量假丝。”
“这种假丝可以分离,与目标结合完成某种化合反应,这是……秃头攻击?”
“一片青苔中可以高密度富集8000单位的极少量新物,特性上与嗜酸乳杆菌有一定类似……嗯?”
随后看着其中的一栏报告,徐云有些疑惑的抬起头,对裘生问道:
“老裘,新物对食物残渣的净化效果最为明显?”
裘生点了点头,指着不远处的一个培养皿道:
“经过我们的初步检测,这种新型微生物可以有效遏制残渣中氨气、有机酸和硫化物的生成。”
“并且对奈瑟氏菌和厌氧链球菌之类的细菌,有着极强的杀伤力。”
徐云微微一愣:
“奈瑟氏菌和厌氧链球菌?”
不过很快,他便反应了过来:
这两种细菌,都是人体唾液和牙龈的标准分泌物之一:
每一毫升的普通唾液里可以寻找出奈瑟氏菌8000万个,在每一克牙龈分泌物中更是可以寻找出10亿个厌氧链球菌。
在食堂里吐出骨头啦、吐出西红柿皮啦、吐出半截蛆虫时沾染上这些细菌,最后流入下水管道是很正常的事情。
接着徐云指着报告,对裘生说道:
“老裘,新种只对食物残渣和唾液细菌有效吗?”
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